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細胞是如何構(gòu)建一個結(jié)構(gòu)來實現(xiàn)遷移
發(fā)布時間:2025-01-24
作者:里來醫(yī)學

一些細胞在體內(nèi)靜止不動,而另一些則可以自由移動。為了實現(xiàn)移動,這些遷移細胞依賴于觸足——這些敏感的、指狀的突起從細胞膜延伸到周圍環(huán)境。在健康細胞中,這種結(jié)構(gòu)至關(guān)重要,例如,當免疫細胞迅速前往感染部位時,它能發(fā)揮重要作用。然而,觸足也可能導致破壞:轉(zhuǎn)移性變異細胞利用觸足侵入身體的新區(qū)域。

觸足由六角形的蛋白質(zhì)束構(gòu)成,賦予其結(jié)構(gòu)和強度。如何形成這些復雜的束結(jié)構(gòu)一直是一個謎題,經(jīng)過40多年的研究,洛克菲勒大學的結(jié)構(gòu)生物物理與力學生物實驗室最終揭開了這個謎團。該實驗室開發(fā)了先進的成像技術(shù)來揭示底層蛋白質(zhì)如何構(gòu)建這些內(nèi)聚組件。

 

這項成果已發(fā)表在《Nature Structural & Molecular Biology》期刊上,研究的第一作者Rui Kong 表示:“理解觸足的結(jié)構(gòu)及其變化,可能有助于優(yōu)化相關(guān)研究方向。”

至于這一發(fā)現(xiàn)將如何影響未來的研究還有待觀察。這項研究首次在原子水平上描繪了如此復雜的高階蛋白質(zhì)組裝體,為其他科學家研究類似的復雜結(jié)構(gòu)提供了新的技術(shù)平臺。實驗室主任Gregory M. Alushin指出:“現(xiàn)在,我們更容易研究這些蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的功能,這些功能在數(shù)千個分子的層面上體現(xiàn)出來。”

Gregory M. Alushin的實驗室專注于研究細胞骨架——包括肌動蛋白在內(nèi)的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)成了細胞的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)。肌動蛋白發(fā)揮多種功能:它為細胞提供整體形狀,幫助細胞感知和產(chǎn)生環(huán)境中的力量,促進細胞之間的連接,以及通過觸足實現(xiàn)細胞運動。

 

圖片信息:由肌束蛋白連接在一起的六邊形肌動蛋白束。

 

這些動態(tài)的蛋白質(zhì)鏈條相互交織,甚至可能進行拉鋸戰(zhàn),但它們必須共同發(fā)揮作用。單根肌動蛋白絲無法單獨完成任何功能。

“這就像一根軟面條,”Alushin說道。“它并不強壯,無法發(fā)揮作用。肌動蛋白絲必須結(jié)合成更高階的結(jié)構(gòu),例如束,才能執(zhí)行有用的任務(wù)。

一種更高階的組裝結(jié)構(gòu)就是觸足內(nèi)的六角束。名為fascin的蛋白質(zhì)將成對的肌動蛋白絲連接在一起,縫合成束。這些束被長膜管包圍,形成觸足,必須足夠堅固以突出細胞外部,同時又具靈活性以適應(yīng)環(huán)境。

Alushin指出:“它們在強度與靈活性之間達到了平衡。”

然而,fascin如何實現(xiàn)這種組裝已經(jīng)是一個“已知的未知數(shù)”數(shù)十年。20世紀70年代,科學家們試圖使用木棍代表肌動蛋白絲,再用小塊木頭作為fascin樣的橋梁拼湊成六角束,但無論如何都無法形成不扭曲的束結(jié)構(gòu)。

近期,高成像技術(shù)(如冷凍電鏡和斷層掃描)首次允許觀察這些束的圖像,但僅僅是模糊的輪廓。在當前研究中, Rui Kong與前洛克菲勒研究生Matthew Reynolds共同領(lǐng)導的研究團隊對他們在2022年開發(fā)的計算圖像分析方法進行了顯著改進 ,該方法涉及對圖像進行“去噪”。

“我們看到了由數(shù)千個fascin分子和數(shù)百個肌動蛋白絲構(gòu)成的實際束,并能夠映射它們的空間位置,”Rui Kong說。“我們觀察到了fascin的結(jié)構(gòu)如何導致其作為肌動蛋白束合劑的功能,并詳細分析了其結(jié)合位點的化學特性。”

令人驚訝的是,fascin表現(xiàn)出相當大的即興能力,它可以通過多種方式構(gòu)建束結(jié)構(gòu)。

Rui Kong指出:“fascin之所以具備這種能力,可能是因為它必須處理的材料并不理想。由于肌動蛋白絲就像扭曲的絲帶,它們并不適合構(gòu)建穩(wěn)固的六角結(jié)構(gòu)。”

為了克服這一問題,fascin展現(xiàn)出結(jié)構(gòu)靈活性,能夠在不同的位置之間滑動并折疊成所需形狀,以便連接這些絲。

Alushin表示:“一個fascin蛋白能容納各種缺陷。它類似于分子鉸鏈,可以在打開和關(guān)閉之間持有多個中間位置,也可以旋轉(zhuǎn)位置以獲得更好地契合。盡管fascin是一個小而簡單的蛋白,但其物理行為非常復雜。”

總而言之,該研究的發(fā)現(xiàn)為理解觸足的形成及其動態(tài)提供了新視角,幫助科學家們進一步探索細胞運動與結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系。

雜志:Nature Structural & Molecular Biology

DOI:10.1038/s41594-024-01477-2 

細胞是如何構(gòu)建一個結(jié)構(gòu)來實現(xiàn)遷移
發(fā)布時間:2025-01-24
作者:里來醫(yī)學

一些細胞在體內(nèi)靜止不動,而另一些則可以自由移動。為了實現(xiàn)移動,這些遷移細胞依賴于觸足——這些敏感的、指狀的突起從細胞膜延伸到周圍環(huán)境。在健康細胞中,這種結(jié)構(gòu)至關(guān)重要,例如,當免疫細胞迅速前往感染部位時,它能發(fā)揮重要作用。然而,觸足也可能導致破壞:轉(zhuǎn)移性變異細胞利用觸足侵入身體的新區(qū)域。

觸足由六角形的蛋白質(zhì)束構(gòu)成,賦予其結(jié)構(gòu)和強度。如何形成這些復雜的束結(jié)構(gòu)一直是一個謎題,經(jīng)過40多年的研究,洛克菲勒大學的結(jié)構(gòu)生物物理與力學生物實驗室最終揭開了這個謎團。該實驗室開發(fā)了先進的成像技術(shù)來揭示底層蛋白質(zhì)如何構(gòu)建這些內(nèi)聚組件。

 

這項成果已發(fā)表在《Nature Structural & Molecular Biology》期刊上,研究的第一作者Rui Kong 表示:“理解觸足的結(jié)構(gòu)及其變化,可能有助于優(yōu)化相關(guān)研究方向。”

至于這一發(fā)現(xiàn)將如何影響未來的研究還有待觀察。這項研究首次在原子水平上描繪了如此復雜的高階蛋白質(zhì)組裝體,為其他科學家研究類似的復雜結(jié)構(gòu)提供了新的技術(shù)平臺。實驗室主任Gregory M. Alushin指出:“現(xiàn)在,我們更容易研究這些蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的功能,這些功能在數(shù)千個分子的層面上體現(xiàn)出來。”

Gregory M. Alushin的實驗室專注于研究細胞骨架——包括肌動蛋白在內(nèi)的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)成了細胞的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)。肌動蛋白發(fā)揮多種功能:它為細胞提供整體形狀,幫助細胞感知和產(chǎn)生環(huán)境中的力量,促進細胞之間的連接,以及通過觸足實現(xiàn)細胞運動。

 

圖片信息:由肌束蛋白連接在一起的六邊形肌動蛋白束。

 

這些動態(tài)的蛋白質(zhì)鏈條相互交織,甚至可能進行拉鋸戰(zhàn),但它們必須共同發(fā)揮作用。單根肌動蛋白絲無法單獨完成任何功能。

“這就像一根軟面條,”Alushin說道。“它并不強壯,無法發(fā)揮作用。肌動蛋白絲必須結(jié)合成更高階的結(jié)構(gòu),例如束,才能執(zhí)行有用的任務(wù)。

一種更高階的組裝結(jié)構(gòu)就是觸足內(nèi)的六角束。名為fascin的蛋白質(zhì)將成對的肌動蛋白絲連接在一起,縫合成束。這些束被長膜管包圍,形成觸足,必須足夠堅固以突出細胞外部,同時又具靈活性以適應(yīng)環(huán)境。

Alushin指出:“它們在強度與靈活性之間達到了平衡。”

然而,fascin如何實現(xiàn)這種組裝已經(jīng)是一個“已知的未知數(shù)”數(shù)十年。20世紀70年代,科學家們試圖使用木棍代表肌動蛋白絲,再用小塊木頭作為fascin樣的橋梁拼湊成六角束,但無論如何都無法形成不扭曲的束結(jié)構(gòu)。

近期,高成像技術(shù)(如冷凍電鏡和斷層掃描)首次允許觀察這些束的圖像,但僅僅是模糊的輪廓。在當前研究中, Rui Kong與前洛克菲勒研究生Matthew Reynolds共同領(lǐng)導的研究團隊對他們在2022年開發(fā)的計算圖像分析方法進行了顯著改進 ,該方法涉及對圖像進行“去噪”。

“我們看到了由數(shù)千個fascin分子和數(shù)百個肌動蛋白絲構(gòu)成的實際束,并能夠映射它們的空間位置,”Rui Kong說。“我們觀察到了fascin的結(jié)構(gòu)如何導致其作為肌動蛋白束合劑的功能,并詳細分析了其結(jié)合位點的化學特性。”

令人驚訝的是,fascin表現(xiàn)出相當大的即興能力,它可以通過多種方式構(gòu)建束結(jié)構(gòu)。

Rui Kong指出:“fascin之所以具備這種能力,可能是因為它必須處理的材料并不理想。由于肌動蛋白絲就像扭曲的絲帶,它們并不適合構(gòu)建穩(wěn)固的六角結(jié)構(gòu)。”

為了克服這一問題,fascin展現(xiàn)出結(jié)構(gòu)靈活性,能夠在不同的位置之間滑動并折疊成所需形狀,以便連接這些絲。

Alushin表示:“一個fascin蛋白能容納各種缺陷。它類似于分子鉸鏈,可以在打開和關(guān)閉之間持有多個中間位置,也可以旋轉(zhuǎn)位置以獲得更好地契合。盡管fascin是一個小而簡單的蛋白,但其物理行為非常復雜。”

總而言之,該研究的發(fā)現(xiàn)為理解觸足的形成及其動態(tài)提供了新視角,幫助科學家們進一步探索細胞運動與結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系。

雜志:Nature Structural & Molecular Biology

DOI:10.1038/s41594-024-01477-2